- গঠন
- বৈশিষ্ট্য
- কর্ম প্রক্রিয়া
- প্রকারভেদ
- -দেহ অনুযায়ী
- - সক্রিয় সাইট অনুসারে
- হিমোপারক্সিডেসিস
- ভ্যানডিয়াম-হ্যালোপারক্সিডেসেস
- অন্যান্য পেরক্সিডেস
- তথ্যসূত্র
Peroxidases বেশিরভাগই এই হাইড্রোজেন পারঅক্সাইড অথবা অন্যান্য সম্পর্কহীন পদার্থ ব্যবহার জৈব এবং অজৈব নিম্নস্তর বিভিন্ন জারণ অনুঘটক এনজাইমের কার্যকলাপের সঙ্গে hemoproteins হয়।
এর বিস্তৃত অর্থে, "পেরোক্সিডেস" শব্দের মধ্যে এনএডি- এবং এনএডিপি-পেরোক্সিডেসস, ফ্যাটি অ্যাসিড-পেরোক্সিডেসস, সাইটোক্রোম-পেরোক্সিডেসস, গ্লুটাথিয়োন-পারক্সাইডেসস এবং অন্যান্য অনেকগুলি অ-নির্দিষ্ট এনজাইম রয়েছে।
হিম-নির্ভর প্যারোক্সিডেস প্রোটিনের চিত্র (উত্স: জওহর স্বামীনাথন এবং উইকিমিডিয়া কমন্সের মাধ্যমে ইউরোপীয় বায়োইনফরমেটিক্স ইনস্টিটিউটে এমএসডি স্টাফ)
তবে, অক্সিডোরডেজাস ক্রিয়াকলাপ রয়েছে এবং হাইড্রোজেন পারক্সাইড এবং অন্যান্য স্তরগুলিকে তাদের জারণ-হ্রাস প্রতিক্রিয়া অনুঘটক করতে নিয়োগ করে এমন বিভিন্ন উত্স থেকে অনস্বীকৃত এনজাইমগুলি বোঝাতে এটি বেশি ব্যবহৃত হয়।
হেম পারক্সিডেস প্রকৃতিতে অত্যন্ত সাধারণ। এগুলি প্রাণী, উচ্চতর উদ্ভিদ, খামির, ছত্রাক এবং ব্যাকটিরিয়ায় পাওয়া যায়।
স্তন্যপায়ী প্রাণীদের মধ্যে এগুলি শ্বেত রক্তকণিকা, জরায়ু, প্লীহা এবং লিভার, লালা গ্রন্থি, পেটের দেয়াল, ফুসফুস, থাইরয়েড গ্রন্থি এবং অন্যান্য টিস্যু দ্বারা উত্পাদিত হয়।
উদ্ভিদে, পেরোক্সিডেসে সর্বাধিক ধনী উদ্ভিদের প্রজাতি হ'র ঘোড়া এবং ডুমুর গাছ। ঘোড়াঘড়ি থেকে শুদ্ধ পেরোক্সিডেস ব্যাপকভাবে অধ্যয়ন করা হয়েছে এবং পরীক্ষামূলক জীববিজ্ঞান এবং জৈব রসায়নের বিভিন্ন উদ্দেশ্যে ব্যবহার করা হয়েছে।
ইউক্যারিওটিক কোষগুলিতে, এই গুরুত্বপূর্ণ এনজাইমগুলি সাধারণত "পেরোক্সিসোমস" নামে পরিচিত বিশেষ অর্গানেলগুলির মধ্যে পাওয়া যায় যা একক ঝিল্লি দ্বারা বেষ্টিত এবং অসংখ্য সেলুলার বিপাকীয় প্রক্রিয়াতে জড়িত।
গঠন
পেরোক্সিডেসের বিভিন্ন শ্রেণীর মধ্যে যে সামান্য হোমোলজি রয়েছে তা সত্ত্বেও, এটি নির্ধারিত হয়েছে যে তাদের গৌণ কাঠামো এবং এটি যেভাবে সংগঠিত হয়েছে তা বিভিন্ন প্রজাতির মধ্যে বেশ সংরক্ষণযোগ্য।
কিছু ব্যতিক্রম রয়েছে, তবে বেশিরভাগ পারক্সাইডেসগুলি হ'ল গ্লাইকোপ্রোটিন এবং কার্বোহাইড্রেটগুলি তাদের উচ্চ তাপমাত্রা স্থিতিশীলতায় অবদান রাখবে বলে মনে করা হয়।
এই প্রোটিনগুলির আণবিক ওজন 35 থেকে 150 কেডিএ পর্যন্ত থাকে যা প্রায় 250 এবং 730 অ্যামিনো অ্যাসিডের অবশিষ্টাংশের সমান।
মায়োলোপারক্সিডেস ব্যতীত, এই ধরণের সমস্ত অণুগুলিতে তাদের কাঠামোতে একটি হিম গ্রুপ থাকে যা বিশ্রামের অবস্থায়, ফে + 3 জারণ অবস্থায় লোহার পরমাণু থাকে। উদ্ভিদগুলির একটি সিনথেটিক গ্রুপ রয়েছে যা ফেরোপর্ফায়ারিন একাদশ নামে পরিচিত।
পেরোক্সিডেসের দুটি স্ট্রাকচারাল ডোমেন রয়েছে যা হেম গ্রুপকে "চারপাশে" মোড়ানো "এবং এই প্রতিটি ডোমেনই একটি জিনের প্রকাশের পণ্য যা সদৃশ ইভেন্টের মধ্য দিয়ে যায়। এই স্ট্রাকচারগুলি 10 টিরও বেশি আলফা হেলিকলগুলি পলিপপটিড লুপ এবং টার্নগুলির সাথে সংযুক্ত are
অণুর যথাযথ ভাঁজ সংরক্ষণ গ্লাইসিন এবং প্রলিন অবশিষ্টাংশের উপস্থিতির উপর নির্ভর করে, পাশাপাশি একটি এস্পার্টিক অ্যাসিড অবশিষ্টাংশ এবং একটি আর্জিনাইন অবশিষ্টাংশ যা উভয় কাঠামোগত ডোমেনকে সংযুক্ত করে যেগুলির মধ্যে একটি লবণের সেতু গঠন করে।
বৈশিষ্ট্য
পেরোক্সিডেস এনজাইমগুলির প্রধান কাজ হ'ল সেলুলার পরিবেশ থেকে হাইড্রোজেন পারক্সাইড অপসারণ, যা বিভিন্ন প্রক্রিয়া দ্বারা উত্পাদিত হতে পারে এবং যা অন্তঃকোষীয় স্থিতিশীলতার জন্য গুরুতর হুমকির প্রতিনিধিত্ব করতে পারে।
যাইহোক, এই প্রতিক্রিয়াশীল অক্সিজেন প্রজাতির অপসারণের এই প্রক্রিয়াতে (যার মধ্যে অক্সিজেনের অন্তর্বর্তী জারণ প্রক্রিয়া রয়েছে), বিপাকের জন্য অন্যান্য গুরুত্বপূর্ণ কার্য সম্পাদন করতে পেরক্সিডেসগুলি এই পদার্থের জারণ ক্ষমতা ব্যবহার করে।
উদ্ভিদে, এই প্রোটিনগুলি রোগজীবাণুতে সংক্রামিত টিস্যুগুলিতে বা শারীরিক ক্ষতির মুখোমুখি হওয়া লিগনিফিকেশন প্রক্রিয়া এবং প্রতিরক্ষা ব্যবস্থার একটি গুরুত্বপূর্ণ অঙ্গ।
বৈজ্ঞানিক প্রসঙ্গে, পেরোক্সিডেসেসের জন্য নতুন অ্যাপ্লিকেশন উদ্ভূত হয়েছে এবং এর মধ্যে রয়েছে ফিনলিক যৌগিকযুক্ত বর্জ্য জলের চিকিত্সা, সুগন্ধযুক্ত যৌগগুলির সংশ্লেষণ এবং খাদ্য বা বর্জ্য পদার্থ থেকে পেরক্সাইড অপসারণ অন্তর্ভুক্ত।
বিশ্লেষণাত্মক এবং ডায়াগোনস্টিক পদগুলিতে, ঘোড়াঘড়ি পেরোক্সিডেজ সম্ভবত সংশ্লেষিত অ্যান্টিবডিগুলি প্রস্তুত করার জন্য সর্বাধিক ব্যবহৃত এনজাইম যা ELISA (এনজাইমযুক্ত লিঙ্কযুক্ত ইমিউনোসোর্বেন্ট অ্যাস) হিসাবে ইমিউনোলজিকাল শোষণ পরীক্ষার জন্য ব্যবহৃত হয় zy বিভিন্ন ধরণের যৌগের নির্ধারণ।
কর্ম প্রক্রিয়া
পেরোক্সিডেসেসের অনুঘটক প্রক্রিয়াটি এনজাইম এবং হাইড্রোজেন পারক্সাইডের সক্রিয় সাইটের মধ্যে মিথস্ক্রিয়া দিয়ে শুরু হওয়া অনুক্রমিক পদক্ষেপের মাধ্যমে ঘটে, যা হেম গ্রুপে লোহার পরমাণুকে জারণ করে এবং যৌগিক I হিসাবে পরিচিত অস্থির মধ্যবর্তী যৌগ তৈরি করে gene (সিওআই)
এরপরে অক্সিডাইজড প্রোটিন (সিওআই) এর একটি হিম গ্রুপ থাকে যার একটি আয়রন পরমাণু থাকে যা অক্সিডেশন রাষ্ট্র তৃতীয় থেকে রাজ্য চতুর্থ দিকে যায় এবং এই প্রক্রিয়াটির জন্য হাইড্রোজেন পারক্সাইড জলে হ্রাস পায়।
যৌগিক প্রথমটি একটি ইলেক্ট্রন দানকারী সাবস্ট্রেটকে জারণবদ্ধ করতে সক্ষম, একটি স্তরকে মূল র্যাডিকাল গঠন করে এবং একটি নতুন রাসায়নিক প্রজাতি হিসাবে পরিচিত যা যৌগিক দ্বিতীয় (সিওআইআই) নামে পরিচিত, যা পরবর্তীতে একটি দ্বিতীয় স্তর অণু দ্বারা হ্রাস করা হয়, এতে আয়রন পুনরুত্থিত হয় তৃতীয় রাজ্য এবং অন্যটি র্যাডিক্যাল উত্পাদন করে।
প্রকারভেদ
-দেহ অনুযায়ী
পেরক্সিডেসগুলি জীব যেখানে পাওয়া যায় তার উপর নির্ভর করে তিনটি শ্রেণিতে বিভক্ত করা হয়েছে:
- প্রথম শ্রেণি: অন্তঃকোষী প্রকারিয়োটিক পারক্সিডেসেস।
- দ্বিতীয় শ্রেণি: বহির্মুখী ছত্রাক পেরোক্সিডেসেস।
- তৃতীয় শ্রেণি: গোপনীয় উদ্ভিজ্জ পেরোক্সিডেসেস।
প্রথম শ্রেণীর প্রোটিনের বিপরীতে, দ্বিতীয় এবং তৃতীয় শ্রেণির শ্রেণীর কাঠামোগুলিতে সিস্টাইনের অবশিষ্টাংশগুলির মধ্যে নির্মিত ডিসসফাইড সেতু রয়েছে, যা তাদের যথেষ্ট বড় অনড়তা দেয়।
দ্বিতীয় এবং তৃতীয় শ্রেণির প্রোটিনগুলিও প্রথম শ্রেণীর চেয়ে পৃথক যে তাদের পৃষ্ঠের উপর সাধারণত গ্লাইকোসিলেশন থাকে।
- সক্রিয় সাইট অনুসারে
যান্ত্রিকভাবে বলতে গেলে, পেরোক্সিডেসগুলি তাদের অনুঘটক কেন্দ্রটিতে পাওয়া পরমাণুর প্রকৃতি অনুসারে শ্রেণিবদ্ধ করা যেতে পারে। এইভাবে, হিমোপারোক্সিডেসস (সর্বাধিক প্রচলিত), ভ্যানিয়ামিয়াম-হ্যালোপারক্সাইডাস এবং অন্যান্য বর্ণনা করা হয়েছে।
হিমোপারক্সিডেসিস
ইতিমধ্যে উল্লিখিত হিসাবে, এই পেরোক্সিডেসগুলি হেম গ্রুপ হিসাবে পরিচিত তাদের অনুঘটক কেন্দ্রটিতে একটি কৃত্রিম গ্রুপ রয়েছে। এই জায়গায় লোহার পরমাণু নাইট্রোজেন পরমাণুর সাথে চারটি বন্ধন সমন্বয় করে।
ভ্যানডিয়াম-হ্যালোপারক্সিডেসেস
হেম গোষ্ঠীর পরিবর্তে ভ্যানডিয়াম-হ্যালোপারক্সাইডেস ভ্যানডেটকে একটি কৃত্রিম গ্রুপ হিসাবে গ্রহণ করে। এই এনজাইমগুলি সামুদ্রিক জীব এবং কিছু পার্থিব ছত্রাক থেকে পৃথক করা হয়েছে।
এই গ্রুপের ভ্যানেডিয়ামটি তিনটি নন-প্রোটিন অক্সিজেন সমন্বিত, একটি হিস্টাইডিন অবশিষ্টাংশের একটি নাইট্রোজেন এবং অ্যাজাইড বন্ধনের একটি নাইট্রোজেন।
অন্যান্য পেরক্সিডেস
হেম বা ভ্যানডিয়াম বাদে বেশ কয়েকটি ব্যাকটিরিয়া হ্যালোপারক্সিডেসগুলি যেমন কৃত্রিম গ্রুপ রয়েছে তাদের এই গ্রুপে শ্রেণিবদ্ধ করা হয়েছে। এই গ্রুপে গ্লুটাথিওন পারক্সাইডেসসও রয়েছে, যার মধ্যে রয়েছে সেলেনো-সিস্টাইন কৃত্রিম গ্রুপ এবং কিছু এনজাইম যা লিগিনিনকে অক্সিডাইজ করতে সক্ষম।
তথ্যসূত্র
- অ্যালবার্টস, বি। ডেনিস, বি। হপকিন, কে।, জনসন, এ। লুইস, জে।, র্যাফ, এম,… ওয়াল্টার, পি। (2004)। প্রয়োজনীয় সেল জীববিজ্ঞান। অ্যাবিডন: গারল্যান্ড সায়েন্স, টেলর এবং ফ্রান্সিস গ্রুপ।
- বানসি, এল। (1997)। পেরোক্সিডেসের স্ট্রাকচারাল বৈশিষ্ট্য। বায়োটেকনোলজির জার্নাল, 53, 253-263।
- দেউরজেন, এমপিজে ভ্যান, রন্টউইজক, এফ ভ্যান, এবং শেল্ডন, আরএ (1997)। পেরক্সিডেসেস দ্বারা নির্বাচিত অক্সিডেশনগুলি অনুঘটকিত। টেট্রহেড্রন, 53 (39), 13183-13220।
- ডানফোর্ড, এইচবি, এবং স্টিলম্যান, জেএস (1976)। পেরক্সিডেসেসের ক্রিয়া এবং কার্যকারিতা সম্পর্কিত। সমন্বয় রসায়ন পর্যালোচনা, 19, 187-251।
- হামিদ, এম।, এবং রেহমান, কে। (২০০৯)। পেরক্সিডেসের সম্ভাব্য অ্যাপ্লিকেশন খাদ্য রসায়ন, 115 (4), 1177-1186।
- কাঁচা, জেডি (1998)। বায়োকেমিস্ট্রি। বার্লিংটন, ম্যাসাচুসেটস: নীল প্যাটারসন পাবলিশার্স।
- স্ট্যানসফিল্ড, ডাব্লুডি, কলম্বি, জেএস, এবং ক্যানো, আরজে (2003)। আণবিক এবং কোষ জীববিজ্ঞান। (কেই কুলেন, এড।) ম্যাকগ্রা-হিল ইবুকস।