এসএসবি প্রোটিন বা প্রোটিন ডিএনএ একক ব্যান্ড বাঁধাই (ইংরেজি থেকে " গুলি কুঁচকি গুলি trand ডিএনএ খ প্রোটিন inding") প্রোটিন, দায়িত্বশীল স্থির রক্ষা ও ক্ষণকালে বজায় রাখা একক ডিএনএ দ্বৈত ডিএনএ বিচ্ছেদ থেকে প্রাপ্ত দল হেলিক্যাস প্রোটিনের ক্রিয়া দ্বারা ব্যান্ড।
কোনও জীবের জিনগত তথ্যটি ডাবল-ব্যান্ড ডিএনএ আকারে সুরক্ষিত এবং এনকোড করা হয়। এটির অনুবাদ ও প্রতিলিপি তৈরি করার জন্য, এটি অবশ্যই অযৌক্তিক এবং আনপেইয়ার করা উচিত এবং এসএসবি প্রোটিনগুলি এতে অংশ নেয়।
একটি প্রতিলিপি প্রোটিন 32 কেডিএ (আরপিএ 32) টুকরো টুকরো টুকরো (উত্স: জওহর স্বামীনাথন এবং উইকিমিডিয়া কমন্সের মাধ্যমে ইউরোপীয় বায়োইনফরম্যাটিক্স ইনস্টিটিউটে এমএসডি স্টাফ)
এই প্রোটিনগুলি সহযোগীভাবে অন্যান্য বিভিন্ন মনোমারের সাথে আবদ্ধ হয় যা তাদের ডিএনএর সাথে স্থিতিশীলতায় অংশ নেয় এবং প্রোকারিওটিস এবং ইউক্যারিওট উভয়ই পাওয়া যায়।
এছেরিচিয়া কোলি এসএসবি প্রোটিন (ইসিএসবি) হ'ল এই ধরণের প্রথম প্রোটিন বর্ণিত। এগুলি কার্যকরী এবং কাঠামোগত বৈশিষ্ট্যযুক্ত ছিল এবং আবিষ্কারের পরে এগুলি এই শ্রেণীর প্রোটিনের জন্য অধ্যয়ন মডেল হিসাবে ব্যবহৃত হয়েছে।
ইউক্যারিওটিক জীবগুলি ব্যাকটেরিয়ার এসএসবি প্রোটিনের অনুরূপ প্রোটিন রাখে, তবে ইউক্যারিওটসে এগুলি আরপিএ প্রোটিন বা রেপ্লিকেশন প্রোটিন এ (রেপ্লিকেশন প্রোটিন এ) হিসাবে পরিচিত যা এসএসবিগুলির সাথে কার্যত অনুরূপ।
এটি আবিষ্কারের পর থেকে গণ্য বায়োকেমিক্যাল-ফাংশনাল মডেলিংটি বিভিন্ন জীবের জিনোমের প্রয়োজনীয় প্রক্রিয়াগুলিতে তাদের ভূমিকা ব্যাখ্যা করার জন্য এসএসবি প্রোটিন এবং একক-স্ট্র্যান্ডড ডিএনএর মধ্যে মিথস্ক্রিয়া অধ্যয়ন করতে ব্যবহৃত হয়।
বৈশিষ্ট্য
এই ধরণের প্রোটিনগুলি জীবনের সমস্ত রাজ্যে পাওয়া যায় এবং যদিও তারা একই কার্যকরী বৈশিষ্ট্যগুলি ভাগ করে, তবে তারা কাঠামোগতভাবে পৃথক, বিশেষত তাদের গঠনমূলক পরিবর্তনের ক্ষেত্রে, যা প্রতিটি ধরণের এসএসবি প্রোটিনের জন্য নির্দিষ্ট বলে মনে হয়।
এই সমস্ত প্রোটিনগুলি একটি সংরক্ষিত ডোমেন ভাগ করে নেওয়ার জন্য পাওয়া গেছে যা একক ব্যান্ড ডিএনএ বাইন্ডিংয়ের সাথে জড়িত এবং এটি অলিগনুক্লিওটাইড / অলিগোস্যাকচারাইড বাইন্ডিং ডোমেন (ওবি ডোমেন হিসাবে সাহিত্যে পাওয়া যায়) হিসাবে পরিচিত।
থার্মাস অ্যাকোয়াটিকাসের মতো থার্মোফিলিক ব্যাকটেরিয়াগুলির এসএসবি প্রোটিনগুলির উল্লেখযোগ্য বৈশিষ্ট্য রয়েছে, যেহেতু প্রতিটি সাবুনিতে দুটি ওবি ডোমেন থাকে, তবে বেশিরভাগ ব্যাকটিরিয়া প্রতিটি সাবুনিতে এইগুলির একটি মাত্র থাকে।
বেশিরভাগ এসএসবি প্রোটিন অ বিশেষভাবে একক ব্যান্ড ডিএনএ-তে আবদ্ধ হয়। তবে প্রতিটি এসএসবির বাঁধাই এর কাঠামো, সহযোগিতার মাত্রা, ওলিগোমারাইজেশনের স্তর এবং বিভিন্ন পরিবেশগত অবস্থার উপর নির্ভর করে।
ডিভল্যান্ট ম্যাগনেসিয়াম আয়নগুলির ঘনত্ব, লবণের ঘনত্ব, পিএইচ, তাপমাত্রা, পলিমাইনস, স্পার্মিডিন এবং স্পার্মিন উপস্থিতি এমন কিছু পরিবেশগত অবস্থার মধ্যে রয়েছে যা বেশিরভাগ এসএসবি প্রোটিনের কার্যকলাপকে প্রভাবিত করে।
গঠন
ব্যাকটিরিয়ায় হোমো-টিট্রামিক এসএসবি প্রোটিন রয়েছে এবং প্রতিটি সাবুনিটের একটিমাত্র ওবি বাইন্ডিং ডোমেন রয়েছে। বিপরীতে, ভাইরাল এসএসবি প্রোটিনগুলি, বিশেষত অনেকগুলি ব্যাকটিরিওফেজগুলির, সাধারণত মনো বা ডাইম্রিক হয়।
তাদের এন-টার্মিনাল প্রান্তে, এসএসবি প্রোটিনগুলি ডিএনএ-বাইন্ডিং ডোমেনের অধিকারী, যখন তাদের সি-টার্মিনাল প্রান্তটি প্রোটিন-প্রোটিন মিথস্ক্রিয়তার জন্য দায়ী নয়টি সংরক্ষিত অ্যামিনো অ্যাসিড দ্বারা গঠিত।
40, 54 এবং 88 পজিশনে তিনটি ট্রিপটোফান অবশিষ্টাংশ হ'ল বাঁধাকৃত ডোমেনগুলিতে ডিএনএর সাথে মিথস্ক্রিয়াটির জন্য দায়বদ্ধ id এগুলি কেবল ডিএনএ-প্রোটিন মিথস্ক্রিয়াকে স্থিতিশীল করতে নয়, অন্যান্য প্রোটিন সাবুনিটদের নিয়োগও মধ্যস্থতা করে।
ই কোলির এসএসবি প্রোটিনকে গণনামূলক গবেষণায় মডেল করা হয়েছে এবং এটি নির্ধারণ করা হয়েছে যে এটির একটি 74 কেডিএ টেট্রামিক কাঠামো রয়েছে এবং এটি বিভিন্ন এসএসবি-জাতীয় সাবুনিটের সহযোগী মিথস্ক্রিয়তার জন্য একক ব্যান্ড ডিএনএকে আবদ্ধ করে।
আরচিয়ায় এসএসবি প্রোটিনও রয়েছে। এগুলি মনোমেরিক এবং একক ডিএনএ-বাইন্ডিং ডোমেন বা ওবি ডোমেন রয়েছে।
ইউক্যারিওটসে, আরপিএ প্রোটিনগুলি কাঠামোগতভাবে বললে আরও জটিল হয়: এগুলি আরপিএ 70, আরপিএ 32 এবং আরপিএ 14 হিসাবে পরিচিত হিটারোট্রিমার (তিনটি পৃথক সাবুনিটের) দ্বারা গঠিত।
তাদের কমপক্ষে ছয়টি অলিগোনুক্লিওটাইড / অলিগোস্যাকচারাইড-বাইন্ডিং ডোমেন রয়েছে, যদিও বর্তমানে এই সাইটের মধ্যে কেবলমাত্র চারটি স্পষ্টরূপে পরিচিত: আরপিএ 70 সাবুনাইটে তিনটি এবং আরপিএ 32 সাবুনিটে চতুর্থ বাসিন্দা।
বৈশিষ্ট্য
এসএসবি প্রোটিনগুলি যখন অন্য এনজাইমের ক্রিয়া দ্বারা প্রকাশিত হয় তখন একক স্ট্র্যান্ডেড ডিএনএ স্ট্র্যান্ডকে সুরক্ষা এবং স্থিতিশীল করে জিনোম রক্ষণাবেক্ষণ, প্যাকেজিং এবং সংস্থার মূল কার্যাদি করে।
এটি লক্ষণীয় গুরুত্বপূর্ণ যে এই প্রোটিনগুলি ডিএনএ স্ট্র্যান্ডগুলি অন্বেষণ এবং খোলার জন্য দায়ী প্রোটিন নয়। এটির ফাংশন কেবলমাত্র ডিএনএকে স্থিতিশীল করতে সীমাবদ্ধ যখন এটি একক ব্যান্ড ডিএনএর অবস্থায় থাকে।
এই এসএসবি প্রোটিনগুলি সহযোগিতামূলকভাবে কাজ করে, যেহেতু এদের মধ্যে একটির মিলন অন্য প্রোটিনের (এসএসবি বা না) মিলনকে সহজতর করে। ডিএনএর বিপাকীয় প্রক্রিয়াগুলিতে এই প্রোটিনগুলি এক ধরণের অগ্রগামী বা প্রাথমিক প্রোটিন হিসাবে বিবেচিত হয়।
একক আটকে থাকা ডিএনএ ব্যান্ডকে স্থিতিশীল করা ছাড়াও ডিএনএতে এই প্রোটিনগুলির বাঁধাইয়ের ভি অ্যান্ডোনোক্লেজ টাইপ দ্বারা এই অণুগুলিকে অবনতি থেকে রক্ষা করার প্রাথমিক কার্যকারিতা রয়েছে।
এসএসবি-জাতীয় প্রোটিনগুলি কার্যত সমস্ত জীবের ডিএনএ প্রতিরূপ প্রক্রিয়ায় সক্রিয়ভাবে অংশগ্রহণ করে। এই জাতীয় প্রোটিনগুলি প্রতিলিপি কাঁটাচামচ অগ্রসর হওয়ার সাথে সাথে অগ্রসর হয় এবং প্যারেন্টালের দুটি ডিএনএ স্ট্র্যান্ডকে আলাদা রাখে যাতে তারা টেমপ্লেট হিসাবে কাজ করার উপযুক্ত অবস্থায় থাকে।
উদাহরণ
ব্যাকটিরিয়ায়, এসএসবি প্রোটিনগুলি রেকা প্রোটিনের ক্রিয়াকলাপকে উদ্দীপিত এবং স্থিতিশীল করে। এই প্রোটিনটি ডিএনএ মেরামত (এসওএস প্রতিক্রিয়া), এবং পরিপূরক একক-ব্যান্ড ডিএনএ অণুর মধ্যে পুনর্বাসনের প্রক্রিয়াটির জন্য দায়ী।
ত্রুটিযুক্ত এসএসবি প্রোটিন পেতে জিনগতভাবে ইঞ্জিনিয়ারড কো। এর মিউট্যান্টগুলি দ্রুত প্রতিরোধ করা হয় এবং কার্যকরভাবে ডিএনএ প্রতিলিপি, মেরামত এবং পুনরায় সংশ্লেষে তাদের কার্য সম্পাদন করে না।
আরপিএ-জাতীয় প্রোটিন ইউক্যারিওটিক কোষে কোষ চক্রের অগ্রগতি নিয়ন্ত্রণ করে। বিশেষত, এটি বিশ্বাস করা হয় যে RPA4 এর সেলুলার ঘনত্বের ডিএনএ প্রতিরূপ পদক্ষেপের উপর পরোক্ষ প্রভাব থাকতে পারে, অর্থাৎ, RPA4 এর উচ্চ ঘনত্বের মধ্যে এই প্রক্রিয়াটি বাধা দেওয়া হয়।
এটি প্রস্তাবিত হয়েছে যে আরপিএ 4 এর অভিব্যক্তি প্রতিরূপ প্রতিরোধ করে এবং প্রাণীজ প্রাণীর স্বাস্থ্যকর কোষের কার্যকারিতা রক্ষণাবেক্ষণ এবং চিহ্নিতকরণে ভূমিকা পালন করে কোষের বিস্তার রোধ করতে পারে।
তথ্যসূত্র
- অ্যান্টনি, ই।, এবং লোহমান, টিএম (2019, ফেব্রুয়ারি)। কো। একক স্ট্র্যান্ডড ডিএনএ বাইন্ডিং (এসএসবি) প্রোটিন-ডিএনএ কমপ্লেক্সের ডায়নামিক্স। সেল এন্ড ডেভেলপমেন্টাল বায়োলজির সেমিনারগুলিতে (খণ্ড 86, পিপি। 102-111)। একাডেমিক প্রেস।
- বের্নিঙ্ক, এইচটি, এবং মর্রিকাল, এসডাব্লু (1999)। আরএমপিএস: পুনঃসংযোগ / প্রতিলিপি মধ্যস্থতাকারী প্রোটিন। জৈব রাসায়নিক পদার্থের প্রবণতা, 24 (10), 385-389।
- বিয়ানকো, পিআর (2017)। এসএসবির গল্প। বায়োফিজিক্স এবং আণবিক জীববিজ্ঞানে অগ্রগতি, 127, 111-118।
- বাইর্ন, বিএম, এবং ওকলি, জিজি (2018, নভেম্বর) প্রতিরূপ প্রোটিন এ, রেচাকৃত যা ডিএনএ নিয়মিত রাখে: জিনোম স্থিতিশীলতা বজায় রাখার ক্ষেত্রে আরপিএ ফসফোরাইলেসের গুরুত্ব। সেল এবং উন্নয়নমূলক জীববিজ্ঞানের সেমিনারগুলিতে। একাডেমিক প্রেস
- ক্রেবস, জেই, গোল্ডস্টেইন, ইএস, এবং কিলপ্যাট্রিক, এসটি (2017)। লেউনের জিন দ্বাদশ। জোন্স এবং বারলেটলেট লার্নিং।
- লেকোয়েন্ট, এফ।, সেরেনা, সি।, ভেল্টেন, এম, কোস্টেস, এ।, ম্যাকগোভার্ন, এস।, মাইল, জেসি,… এবং পোলার্ড, পি। (2007)। ক্রোমোসোমাল প্রতিলিপি কাঁটাচামচ গ্রেপ্তারের প্রত্যাশা: এসএসবি সক্রিয় কাঁটাচামচগুলির জন্য ডিএনএ হেলিক্যাসিকেগুলি মেরামত করে লক্ষ্য করে। ইএমবিও জার্নাল, 26 (19), 4239-4251।