- অ্যামিনো অ্যাসিড
- অ্যালিফ্যাটিক অ্যামিনো অ্যাসিড
- হাইড্রোক্সিল- বা সালফারযুক্ত সাইড চেইন সহ অ্যামিনো অ্যাসিড
- চক্রীয় অ্যামিনো অ্যাসিড
- সুগন্ধযুক্ত অ্যামিনো অ্যাসিড
- বেসিক অ্যামিনো অ্যাসিড
- অ্যাসিডিক অ্যামিনো অ্যাসিড এবং তাদের অ্যামাইডস
- পেপটাইড বন্ড
- অ্যামিনো অ্যাসিড ক্রম
- প্রোটিন কোডিং
- তথ্যসূত্র
প্রোটিনের প্রাথমিক গঠন ক্রমে polypeptide বা polypeptides যে তাদের জন্য এর অ্যামিনো অ্যাসিড আয়োজন করা হয়। একটি প্রোটিন একটি বায়োপলিমার যা পেপটাইড বন্ডের সাথে যুক্ত α-অ্যামিনো অ্যাসিড মনোমরস দ্বারা গঠিত। প্রতিটি প্রোটিনের এই অ্যামিনো অ্যাসিডগুলির একটি নির্ধারিত অনুক্রম থাকে।
প্রোটিনগুলি সাইটোস্কেলটনের মাধ্যমে কোষের অখণ্ডতা রুপায়ণ এবং রক্ষণাবেক্ষণ, অ্যান্টিবডিগুলির মাধ্যমে বিদেশী এজেন্টদের থেকে দেহকে রক্ষা করা এবং এনজাইমের মাধ্যমে দেহে রাসায়নিক ক্রিয়াকলাপকে উত্সাহিত করা সহ বিভিন্ন ধরণের জৈবিক কার্য সম্পাদন করে।
প্রোটিনগুলির প্রাথমিক, মাধ্যমিক, তৃতীয় এবং চতুর্ভুজ কাঠামো, ত্রি-মাত্রিক রূপান্তর। নেওয়া এবং সম্পাদনা করেছেন: আলেজান্দ্রো পোর্তো।
আজ, প্রোটিনগুলির সংমিশ্রণ এবং অ্যামিনো অ্যাসিডগুলি যে ক্রমে সাজানো হয়েছে (সিকোয়েন্সিং) নির্ধারণ করা তা বছর আগের তুলনায় দ্রুত। এই তথ্য আন্তর্জাতিক বৈদ্যুতিন ডাটাবেসে জমা দেওয়া হয়, যা ইন্টারনেটের মাধ্যমে অ্যাক্সেস করা যায় (জেনব্যাঙ্ক, পিআইআর, অন্যদের মধ্যে)।
অ্যামিনো অ্যাসিড
অ্যামিনো অ্যাসিডগুলি এমন অণু যা একটি অ্যামিনো গ্রুপ এবং একটি কার্বক্সিলিক অ্যাসিড গ্রুপ ধারণ করে। Α-অ্যামিনো অ্যাসিডের ক্ষেত্রে তাদের একটি কেন্দ্রীয় কার্বন পরমাণু (α কার্বন) থাকে যার সাথে অ্যামিনো গ্রুপ এবং কারবক্সিল গ্রুপ উভয়ই সংযুক্ত থাকে, একটি হাইড্রোজেন পরমাণু এবং একটি স্বতন্ত্র আর গ্রুপ ছাড়াও, যাকে বলে পাশের শিকল.
Carbon-কার্বনের এই কনফিগারেশনের কারণে, অ্যামিনো অ্যাসিডগুলি গঠিত হয়, যা α-অ্যামিনো অ্যাসিড নামে পরিচিত, এটি চিরাল হয়। দুটি ফর্ম উত্পাদিত হয় যা একে অপরের মিরর ইমেজ এবং একে এল এবং ডি এন্যান্টিওমার বলে।
জীবিত প্রাণীদের সমস্ত প্রোটিনগুলি এল কনফিগারেশনের 20 am-অ্যামিনো অ্যাসিড দ্বারা গঠিত these 20 অ্যামিনো অ্যাসিডের পার্শ্ব চেইনগুলি পৃথক এবং রাসায়নিক গ্রুপগুলির একটি বিচিত্র বৈচিত্র রয়েছে।
মূলত, way-অ্যামিনো অ্যাসিডগুলি নিম্নোক্ত উপায়ে সাইড চেইনের ধরণের উপর নির্ভর করে গ্রুপ করা যেতে পারে (নির্বিচারে)।
অ্যালিফ্যাটিক অ্যামিনো অ্যাসিড
এই লেখায় কিছু লেখকের মতে, গ্লাইসিন (গ্লি), অ্যালানাইন (আলা), ভ্যালাইন (ভাল), লিউসিন (লেউ) এবং আইসোলিউসিন (আইলে) রয়েছে contained অন্যান্য লেখকদের মধ্যে মেথোনিন (মেট) এবং প্রোলিন (প্রো) অন্তর্ভুক্ত রয়েছে।
হাইড্রোক্সিল- বা সালফারযুক্ত সাইড চেইন সহ অ্যামিনো অ্যাসিড
এটিতে সেরিন (সের), সিস্টাইন (সিস), থ্রেওনাইন (থ্র) এবং মেথোনিনও রয়েছে। কিছু লেখকের মতে, গোষ্ঠীতে কেবল সের এবং থার অন্তর্ভুক্ত করা উচিত।
চক্রীয় অ্যামিনো অ্যাসিড
সম্পূর্ণ প্রোলিন দিয়ে তৈরি, যা ইতিমধ্যে উল্লিখিত রয়েছে, অন্যান্য লেখকরা এলিফ্যাটিক অ্যামিনো অ্যাসিডের মধ্যে অন্তর্ভুক্ত করেছেন।
সুগন্ধযুক্ত অ্যামিনো অ্যাসিড
ফেনিল্লানাইন (ফেই), টাইরোসিন (টায়ার) এবং ট্রাইপটোফান (ট্রপ))
বেসিক অ্যামিনো অ্যাসিড
হিস্টিডাইন (তাঁর), লাইসাইন (লাইস) এবং আর্জিনাইন (আরগ)
অ্যাসিডিক অ্যামিনো অ্যাসিড এবং তাদের অ্যামাইডস
এটিতে অ্যাসপার্টিক (অ্যাস্প) এবং গ্লুটামিক (গ্লু) অ্যাসিড এবং অ্যামাইডস অ্যাসপারজিন (অ্যাসন) এবং গ্লুটামাইন (গ্লেন) রয়েছে। কিছু লেখক এই শেষ দলটিকে দুটি করে আলাদা করেছেন; একদিকে অ্যাসিডিক অ্যামিনো অ্যাসিড (প্রথম দুটি) এবং অন্যদিকে কার্বোঅক্সিলাইড (বাকি দুটি) রয়েছে।
পেপটাইড বন্ড
পেপটাইড বন্ডের মাধ্যমে এমিনো অ্যাসিড একে অপরের সাথে যুক্ত হতে পারে। এই বন্ডগুলি, অ্যামাইড বন্ড নামে পরিচিত, একটি এমিনো অ্যাসিডের α-amino গ্রুপ এবং অন্যটির α-carboxyl গ্রুপের মধ্যে প্রতিষ্ঠিত হয়। এই ইউনিয়নটি একটি জলের অণুর ক্ষতি নিয়ে গঠিত হয়।
দুটি অ্যামিনো অ্যাসিডের মধ্যে মিলনের ফলে একটি ডিপপটিড তৈরি হয় এবং যদি নতুন অ্যামিনো অ্যাসিড যুক্ত করা হয় তবে ট্রিপপটিডস, টেট্রাপেপটিডস এবং এই জাতীয় ক্রমান্বয়ে গঠিত হতে পারে।
অল্প সংখ্যক অ্যামিনো অ্যাসিড দ্বারা গঠিত পলিপেপটিডগুলিকে সাধারণত অলিগোপপটিডস বলা হয় এবং যদি অ্যামিনো অ্যাসিডের সংখ্যা বেশি হয় তবে তাদের পলিপেপটাইড বলে।
পলিপপটিড চেইনে যুক্ত প্রতিটি অ্যামিনো অ্যাসিড একটি পানির অণু ছেড়ে দেয়। বাঁধার সময় অ্যামিনো অ্যাসিডের যে অংশ H + বা OH- হারিয়ে ফেলেছে তাকে অ্যামিনো অ্যাসিডের অবশিষ্টাংশ বলে।
এই অলিগোপপটিড এবং পলিপপটিড চেইনের বেশিরভাগটি এক প্রান্তে একটি এমিনো-টার্মিনাল গ্রুপ (এন-টার্মিনাল) এবং অন্যটিতে একটি টার্মিনাল কারবক্সিল (সি-টার্মিনাল) থাকবে। তদতিরিক্ত, এগুলিতে অ্যামিনো অ্যাসিডের অবশিষ্টাংশগুলির পার্শ্ব চেইনের মধ্যে অনেকগুলি আয়নীয়যোগ্য গ্রুপ থাকতে পারে যা তাদের তৈরি করে। এই কারণে, তারা পলিম্পোলিথ হিসাবে বিবেচিত হয়।
দুটি অ্যামিনো অ্যাসিডের মধ্যে পেপটাইড বন্ড গঠন। নেওয়া এবং সম্পাদনা করেছেন: আলেজান্দ্রো পোর্তো।
অ্যামিনো অ্যাসিড ক্রম
প্রতিটি প্রোটিনের এমিনো অ্যাসিডের অবশিষ্টাংশগুলির একটি নির্দিষ্ট ক্রম থাকে। এই ক্রমটিই প্রোটিনের প্রাথমিক কাঠামো হিসাবে পরিচিত।
প্রতিটি জীবের প্রতিটি পৃথক প্রোটিন নির্দিষ্ট প্রজাতি। অর্থাৎ, মানুষের মায়োগ্লোবিনটি অন্য একজন মানুষের মতো, তবে অন্যান্য স্তন্যপায়ী প্রাণীর মায়োগ্লোবিনগুলির সাথে এটির সামান্য পার্থক্য রয়েছে।
একটি প্রোটিনের পরিমাণ এবং ধরণের অ্যামিনো অ্যাসিডগুলি পলিপপটিড চেইনের মধ্যে এই অ্যামিনো অ্যাসিডগুলির অবস্থান হিসাবে গুরুত্বপূর্ণ। প্রোটিনগুলি বুঝতে, জৈব রসায়নবিদদের প্রথমে প্রতিটি নির্দিষ্ট প্রোটিনকে পৃথক করে বিশুদ্ধ করতে হবে, তারপরে একটি অ্যামিনো অ্যাসিড সামগ্রী বিশ্লেষণ করতে হবে এবং শেষ পর্যন্ত এর ক্রমটি নির্ধারণ করবে।
প্রোটিনকে বিচ্ছিন্ন ও বিশুদ্ধ করার বিভিন্ন পদ্ধতি রয়েছে, যার মধ্যে রয়েছে: সেন্ট্রিফিউগেশন, ক্রোমাটোগ্রাফি, জেল পরিস্রাবণ, ডায়ালাইসিস এবং আল্ট্রাফিল্ট্রেশন, পাশাপাশি অধ্যয়নের অধীনে প্রোটিনের দ্রবণীয়তা বৈশিষ্ট্যগুলির ব্যবহার।
প্রোটিনে উপস্থিত অ্যামিনো অ্যাসিডগুলির সংকল্পটি তিনটি ধাপ অনুসরণ করে সম্পন্ন করা হয়। প্রথমটি হাইড্রোলাইসিস দ্বারা পেপটাইড বন্ধন ভাঙ্গা। পরবর্তীকালে, মিশ্রণে বিভিন্ন ধরণের অ্যামিনো অ্যাসিড পৃথক করা হয়; এবং পরিশেষে, প্রাপ্ত এমিনো অ্যাসিডগুলির প্রতিটি একের পরিমাণ নির্ধারণ করা হয়।
প্রোটিনের প্রাথমিক কাঠামো নির্ধারণ করতে, বিভিন্ন পদ্ধতি ব্যবহার করা যেতে পারে; তবে বর্তমানে সর্বাধিক ব্যবহৃত হয় হ'ল এডম্যান পদ্ধতি, যা মূলত এন টার্মিনাল অ্যামিনো অ্যাসিডকে বাকী চেইনের সাথে বারবার চিহ্নিত করা এবং পৃথকভাবে প্রকাশিত প্রতিটি অ্যামিনো অ্যাসিড চিহ্নিত করে নিয়ে গঠিত।
প্রোটিন কোডিং
প্রোটিনের প্রাথমিক কাঠামোটি জীবের জিনগুলিতে এনকোড থাকে। জেনেটিক তথ্য ডিএনএতে অন্তর্ভুক্ত থাকে তবে প্রোটিনে অনুবাদ করার জন্য এটি প্রথমে এমআরএনএ অণুতে প্রতিলিপি হতে হবে। প্রতিটি নিউক্লিওটাইড ট্রিপলেট (কোডন) একটি অ্যামিনো অ্যাসিডের কোডগুলি।
যেহেতু এখানে possible৪ টি সম্ভাব্য কোডন রয়েছে এবং প্রোটিন তৈরিতে কেবল 20 টি অ্যামিনো অ্যাসিড ব্যবহৃত হয়, প্রতিটি এমিনো অ্যাসিড একাধিক কোডন দ্বারা এনকোড করা যায়। কার্যত সমস্ত জীবন্ত জিনিস একই অ্যামিনো অ্যাসিডের কোডে একই কোডন ব্যবহার করে। সুতরাং, জেনেটিক কোডটিকে প্রায় সর্বজনীন ভাষা হিসাবে বিবেচনা করা হয়।
এই কোডে, পলিপপটিডের অনুবাদ শুরু এবং থামাতে ব্যবহৃত কোডন রয়েছে। স্টপ কোডনগুলি কোনও অ্যামিনো অ্যাসিডের কোড দেয় না, তবে চেইনের সি-টার্মিনাসে অনুবাদ বন্ধ করে, এবং ইউএএ, ইউএজি এবং ইউজিএ দ্বারা ট্রিপলগুলি প্রতিনিধিত্ব করে।
অন্যদিকে, এওজি কোডন সাধারণত স্টার্ট সিগন্যাল হিসাবে কাজ করে এবং মেথিয়নিনের কোডও দেয়।
অনুবাদ করার পরে, প্রোটিনগুলি তাদের চূড়ান্ত কনফিগারেশনটি অর্জন করার জন্য কিছু প্রক্রিয়াকরণ বা সংশোধন, যেমন খণ্ড খণ্ড দ্বারা সংক্ষিপ্তকরণের মধ্য দিয়ে যেতে পারে।
তথ্যসূত্র
- সি কে ম্যাথিউস, কেই ভ্যান হোল্ডি এবং কেজি অহরেন। 2002. বায়োকেমিস্ট্রি। 3 তম সংস্করণ। বেঞ্জামিন / কামিংস পাবলিশিং সংস্থা, ইনক।
- মারে, পি। ময়েস, ডিসি গ্রানার এবং ভিডাব্লু রডওয়েল। 1996. হার্পারের বায়োকেমিস্ট্রি। অ্যাপলটন ও ল্যাঞ্জ
- জেএম বার্গ, জেএল টিমোকজকো এবং এল স্ট্রিয়ার (এনডি)। Biochemestry। 5 তম সংস্করণ। ডব্লিউএইচ ফ্রিম্যান অ্যান্ড কোম্পানি।
- জে কুলম্যান এবং কে.এইচ রোহম (2005)। জৈব রসায়নের রঙের অ্যাটলাস। 2 য় সংস্করণ। Thieme।
- উ: লেহনঞ্জার (1978)। বায়োকেমিস্ট্রি। এডিকিনিস ওমেগা, এসএ
- এল স্ট্রিয়ার (1995)। Biochemestry। ডাব্লুএইচ ফ্রিম্যান অ্যান্ড কোম্পানি, নিউ ইয়র্ক।