- অধ্যয়ন পদ্ধতি
- ডিএনএ সিকোয়েন্সিং এবং একক নিউক্লিওটাইড পলিমॉर्ফিজমের সনাক্তকরণ (এসএনপি)
- মাইক্রোসেটেলাইটস (এসএসআরএস)
- পরিবর্ধিত খণ্ড দৈর্ঘ্য বহুবর্ষ (এএফএলপি)
- রোগ নির্ণয় এবং রোগ
- উদাহরণ
- তথ্যসূত্র
একজন হেপ্লোটাইপ জিনোম একাধিক প্রজন্মের মাধ্যমে একসঙ্গে উত্তরাধিকারসূত্রে হতে থাকে একটি অঞ্চলের হয়; সাধারণত এটি একই ক্রোমোজোমে থাকে। হ্যাপ্লোটাইপস জিনগত সংযোগের পণ্য এবং জেনেটিক পুনঃসংযোগের সময় অক্ষত থাকে।
"হ্যাপ্লোটাইপ" শব্দটি "হ্যাপলয়েড" শব্দ এবং "জিনোটাইপ" শব্দের সংমিশ্রণ থেকে এসেছে। "হ্যাপলয়েড" ক্রোমোজোমের একক সেটযুক্ত কোষগুলিকে বোঝায় এবং "জিনোটাইপ" কোনও জীবের জিনগত মেকআপকে বোঝায়।
এশীয় জনগোষ্ঠীতে ওয়াই ক্রোমোজোম হ্যাপ্লোটাইপগুলি বিতরণের পরিকল্পনা (উত্স: উইকিমিডিয়া কমন্সের মাধ্যমে মোগালর্ড) সংজ্ঞা অনুসরণ করে একটি হ্যাপ্লোটাইপ একটি জিন বা আরও বেশি কিছু জুড়ে বর্ণনা করতে পারে যা পিতামাতার কাছ থেকে ক্রোমোসোমে একসাথে উত্তরাধিকার সূত্রে প্রাপ্ত হয়, বা এটি কোনও ক্রোমোজোমকে বর্ণনা করতে পারে যা পুরোপুরি পিতামাতার কাছ থেকে উত্তরাধিকার সূত্রে প্রাপ্ত হয়, যেমন পুরুষদের মধ্যে ওয়াই ক্রোমোসোম।
উদাহরণস্বরূপ, যখন হ্যাপলোটাইপগুলি চুলের রঙ এবং চোখের বর্ণের মতো দুটি ভিন্ন ফেনোটাইপিক চরিত্রের জন্য জিন ভাগ করে, তখন চুলের রঙের জন্য জিনটি ধারণকারী ব্যক্তিরাও চোখের বর্ণের জন্য অন্য জিনটি অধিকার করতে পারেন।
বংশবৃত্তির অধ্যয়নের জন্য, রোগের উত্স সনাক্ত করতে, জেনেটিক পরিবর্তনশীলতা এবং বিভিন্ন ধরণের জীবের জনগণের ফিলোজোগ্রাফি চিহ্নিত করার জন্য হ্যাপলোটাইপস বর্তমানে অন্যতম একটি সরঞ্জাম।
হ্যাপ্লোটাইপস অধ্যয়নের জন্য একাধিক সরঞ্জাম রয়েছে, বর্তমানে সবচেয়ে বেশি ব্যবহৃত একটি "হ্যাপলোটাইপ ম্যাপ" (হ্যাপম্যাপ), যা এমন একটি ওয়েব পৃষ্ঠা যা এটি নির্ধারণ করতে দেয় যে হ্যাপলোটাইপগুলি জিনোম বিভাগগুলি কোনটি।
অধ্যয়ন পদ্ধতি
হ্যাপ্লোটাইপস জিনের উত্তরাধিকার এবং তাদের বহুত্ব বোঝার সুযোগকে প্রতিনিধিত্ব করে। "পলিমেরেজ চেইন রিঅ্যাকশন" (পিসিআর) কৌশল আবিষ্কারের সাথে হ্যাপ্লোটাইপস অধ্যয়নের ক্ষেত্রে অনেক অগ্রগতি হয়েছিল।
বর্তমানে হ্যাপ্লোটাইপস অধ্যয়নের জন্য অসংখ্য পদ্ধতি রয়েছে, সর্বাধিক অসামান্য কয়েকটি হ'ল:
ডিএনএ সিকোয়েন্সিং এবং একক নিউক্লিওটাইড পলিমॉर्ফিজমের সনাক্তকরণ (এসএনপি)
নেক্সট-প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং প্রযুক্তির বিকাশ হ্যাপ্লোটাইপস অধ্যয়নের জন্য দুর্দান্ত লিপকে উপস্থাপন করে। নতুন প্রযুক্তি হ্যাপ্লোটাইপের নির্দিষ্ট অঞ্চলে একক নিউক্লিয়োটাইড বেস পর্যন্ত বিভিন্নতা সনাক্ত করা সম্ভব করে।
বায়োইনফরম্যাটিক্সে, হ্যাপ্লোটাইপ শব্দটি ডিএনএ সিকোয়েন্সগুলিতে একক নিউক্লিওটাইড পলিমর্ফিজমের (এসএনপি) একটি গ্রুপের উত্তরাধিকারকে বোঝাতেও ব্যবহৃত হয়।
পরবর্তী প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং ব্যবহার করে হ্যাপ্লোটাইপ সনাক্তকরণের সাথে বায়োইনফরম্যাটিক্স প্রোগ্রামগুলির সংমিশ্রণের মাধ্যমে, জনসংখ্যার জিনোমে প্রতিটি বেস পরিবর্তনের অবস্থান, প্রতিস্থাপন এবং প্রভাব সঠিকভাবে চিহ্নিত করা যায়।
মাইক্রোসেটেলাইটস (এসএসআরএস)
মাইক্রোসেটেলাইট বা এসএসআরএস তাদের নামটি ইংরেজী "এস প্রয়োগ সিকোয়েন্স রিপিট এবং শর্ট ট্যান্ডম রিপিট" থেকে পেয়েছে। এগুলি সংক্ষিপ্ত নিউক্লিওটাইড সিকোয়েন্স যা জিনোমের কোনও অঞ্চলে পর পর পুনরাবৃত্তি হয়।
নন-কোডিং হ্যাপলোটাইপের অভ্যন্তরে মাইক্রোসেটেলগুলি খুঁজে পাওয়া সাধারণ, অতএব, মাইক্রোসেটেল পুনরাবৃত্তির সংখ্যার বিভিন্নতা সনাক্তকরণের মাধ্যমে ব্যক্তিদের হ্যাপ্লোটাইপগুলির বিভিন্ন এলিল লক্ষ্য করা যায়।
পাপায়া (কারিকা পেঁপে) এর মতো উদ্ভিদের যৌনতা থেকে শুরু করে সিক্ল সেল অ্যানিমিয়ার মতো মানব রোগ সনাক্তকরণ পর্যন্ত হ্যাপ্লোটাইপগুলির একটি অগণিত সনাক্তকরণের জন্য অণু মাইক্রোসেটেল চিহ্নিতকারীগুলি তৈরি করা হয়েছে।
পরিবর্ধিত খণ্ড দৈর্ঘ্য বহুবর্ষ (এএফএলপি)
এই কৌশলটি ডিএনএ হজমের সাথে দুটি পৃথক বিধিনিষেধযুক্ত এনজাইমগুলির সাথে পিসিআর প্রতিক্রিয়াগুলির সাথে প্রশস্তকরণকে একত্রিত করে। প্রযুক্তিটি ডিএনএ অনুক্রমের বিভিন্ন ক্লিভেজ সাইট অনুসারে হ্যাপ্লোটাইপগুলিতে পলিমারফিক লোকে সনাক্ত করে।
কৌশলটি আরও ভালভাবে বোঝানোর জন্য, আসুন একই দৈর্ঘ্যের তিনটি ফ্যাব্রিক টুকরো কল্পনা করুন, তবে বিভিন্ন সাইটে কাটা (এই টুকরোগুলি তিনটি পিসিআর-প্রশস্ত হ্যাপলাইটের টুকরো উপস্থাপন করে)।
ফ্যাব্রিকটি কাটা হওয়ার পরে, বিভিন্ন আকারের অনেক টুকরো পাওয়া যাবে, যেহেতু প্রতিটি ফ্যাব্রিক বিভিন্ন জায়গায় কাটা হয়। তারা যে ধরণের ফ্যাব্রিক থেকে আসে সেই অনুসারে খণ্ডগুলি অর্ডার করে আমরা কাপড়ের মধ্যে বা হ্যাপ্লোটাইপগুলির মধ্যে পার্থক্য কোথায় পাওয়া যায় তা পর্যবেক্ষণ করতে সক্ষম হব।
রোগ নির্ণয় এবং রোগ
হ্যাপ্লোটাইপসের জিনগত অধ্যয়নের একটি গুরুত্বপূর্ণ সুবিধা হ'ল তারা হাজার হাজার প্রজন্মের জন্য প্রায় অক্ষত বা অবরুদ্ধ থেকে যায় এবং এটি প্রত্যন্ত পূর্বপুরুষদের সনাক্তকরণ এবং ব্যক্তিদের রোগের বিকাশে অবদান রাখার প্রতিটি পরিবর্তনকে সনাক্ত করতে সহায়তা করে।
মানবতার মধ্যে হ্যাপ্লোটাইপগুলি জাতিগুলির উপর নির্ভর করে পরিবর্তিত হয় এবং এর ভিত্তিতে জিনগুলি হ্যাপ্লোটাইপগুলির মধ্যে সনাক্ত করা যায় যা মানব জাতির প্রতিটি ক্ষেত্রে গুরুতর রোগের কারণ হয়ে থাকে।
হ্যাপম্যাপ প্রকল্পে চারটি জাতিগত গোষ্ঠী রয়েছে: ইউরোপীয়ান, নাইজেরিয়ান, ইওরোবা, হান চাইনিজ এবং জাপানি।
এইভাবে, হ্যাপম্যাপ প্রকল্পটি বিভিন্ন জনসংখ্যার গোষ্ঠীগুলি কভার করতে পারে এবং উত্তরাধিকারসূত্রে প্রাপ্ত বহু রোগের উদ্ভব এবং বিবর্তন সনাক্ত করতে পারে যা চারটি বর্ণের প্রতিটিকেই প্রভাবিত করে।
হ্যাপ্লোটাইপ বিশ্লেষণ ব্যবহার করে যে রোগগুলির প্রায়শই নির্ণয় করা হয় তার মধ্যে একটি হ'ল মানুষের মধ্যে সিকেল সেল অ্যানিমিয়া। একটি জনসংখ্যায় আফ্রিকান হ্যাপ্লোটাইপসের ফ্রিকোয়েন্সি ট্র্যাক করে এই রোগ নির্ণয় করা হয়।
আফ্রিকায় আদিবাসী একটি রোগ হওয়ার কারণে, জনসংখ্যায় আফ্রিকান হ্যাপ্লোটাইপগুলি চিহ্নিত করে সিক্ল-আকৃতির এরিথ্রোসাইটস (প্যাথলজির বৈশিষ্ট্য) এর বিটা গ্লোবিনগুলির জেনেটিক সিকোয়েন্সে রূপান্তরিত লোকদের সন্ধান করা সহজ করে তোলে।
উদাহরণ
হ্যাপ্লোটাইপস সহ, ফাইলোজেনেটিক গাছগুলি নির্মিত হয় যা হ্যামলোজাস ডিএনএ অণুগুলির নমুনায় বা একই প্রজাতি থেকে পাওয়া এমন একটি অঞ্চলে, যেখানে খুব কম বা কোনও পুনরায় সমন্বয় নেই এমন প্রতিটি হ্যাপ্লোটাইপগুলির মধ্যে বিবর্তনমূলক সম্পর্কের প্রতিনিধিত্ব করে।
হ্যাপ্লোটাইপসের মাধ্যমে সর্বাধিক অধ্যয়ন করা শাখা হ'ল মানব প্রতিরোধ ব্যবস্থাটির বিবর্তন। টোল-এর মতো রিসেপ্টরকে এনকোডিং করা হ্যাপলোটাইপস (জন্মগত প্রতিরোধ ব্যবস্থার মূল উপাদান) সনাক্ত করা হয়েছে নিয়ান্ডারথাল এবং ডেনিসভান জিনোমের জন্য।
এটি তাদের "আধুনিক" মানুষের জনসংখ্যার জেনেটিক ক্রমগুলি হ্যাপলাইটাইপ ক্রমগুলি থেকে কীভাবে পরিবর্তিত হয়েছে তা ট্র্যাক করতে দেয় যা "পূর্বপুরুষ" মানুষের সাথে মিলে যায়।
মাইটোকন্ড্রিয়াল হ্যাপ্লোটাইপস থেকে জিনগত সম্পর্কের একটি নেটওয়ার্ক তৈরি করা অধ্যয়ন করে যে কীভাবে প্রজাতিতে প্রবর্তক প্রভাব ঘটে, কারণ বিজ্ঞানীরা এটি চিহ্নিত করতে দেয় যখন জনগোষ্ঠী তাদের মধ্যে প্রজনন বন্ধ করে দিয়েছিল এবং পৃথক প্রজাতি হিসাবে নিজেকে প্রতিষ্ঠিত করে।
নেপালি জনসংখ্যায় হ্যাপ্লোটাইপ আর (ওয়াই-ডিএনএ) বিতরণ (উত্স: মৌলুসিওনি, উইকিমিডিয়া কমন্সের মাধ্যমে) বন্দী-বংশজাত প্রাণীগুলির জিনগত বৈচিত্র্যকে ট্র্যাক এবং অধ্যয়নের জন্য হ্যাপ্লোটাইপ বৈচিত্র্য ব্যবহৃত হয়। এই কৌশলগুলি বিশেষত এমন প্রজাতির জন্য ব্যবহৃত হয় যা বুনোতে নজরদারি করা কঠিন।
বন্দুক জনগোষ্ঠীর জিনগত অবস্থান নিরীক্ষণের জন্য প্রাণিজ প্রজাতি যেমন হাঙ্গর, পাখি এবং জগুয়ার, হাতি ইত্যাদির মতো বৃহত স্তন্যপায়ী প্রাণীর নিয়মিত জিনগতভাবে মূল্যায়ন করা হয়।
তথ্যসূত্র
- বাহলো, এম।, স্টানকোভিচ, জে।, স্পিড, টিপি, রুবিও, জেপি, বারফুট, আরকে, এবং ফুয়েট, এসজে (2006)। এসএনপি বা মাইক্রোসেটেলাইট হ্যাপ্লোটাইপ ডেটা ব্যবহার করে জিনোম প্রশস্ত হ্যাপ্লোটাইপ ভাগ করে নেওয়া সনাক্ত করা। মানব জেনেটিক্স, 119 (1-2), 38-50।
- ড্যানম্যানম্যান, এম।, আন্দ্রেস, এএম, এবং কেলসো, জে। (২০১ 2016)। নিয়ান্ডারটাল এবং ডেনিসোভান-জাতীয় হ্যাপ্লোটাইপসগুলির ভূমিকা মানুষের টোল-জাতীয় রিসেপ্টরগুলিতে অভিযোজিত পরিবর্তনের ক্ষেত্রে অবদান রাখে। আমেরিকান জার্নাল অফ হিউম্যান জেনেটিক্স, 98 (1), 22-33।
- ডি ভ্রিজ, এইচজি, ভ্যান ডার মুলেন, এমএ, রোজেন, আর।, হ্যালি, ডিজে, শেফার, এইচ।, লিও, পি।,… এবং তে মেরম্যান, জিজে (1996)। যে ব্যক্তিরা সিএফটিআর মিউটেশন এলিল ভাগ করে থাকেন তাদের মধ্যে হ্যাপ্লোটাইপ পরিচয় "বংশদ্ভুতভাবে অভিন্ন": আসল জনগোষ্ঠীতে জিন ম্যাপিংয়ের জন্য হ্যাপ্লোটাইপ-ভাগ করে নেওয়ার ধারণার কার্যকারিতা প্রদর্শন। মানব জেনেটিক্স, 98 (3), 304-309
- দেগলি-এস্পোস্টি, এমএ, লিভার, আ.লীগ, ক্রিশ্চেনসেন, এফটি, উইট, সিএস, আব্রাহাম, এলজে, এবং ডকিন্স, আরএল (1992)। পূর্বপুরুষের হ্যাপ্লোটাইপস: সংরক্ষিত জনসংখ্যা এমএইচসি হ্যাপলোটাইপস। হিউম্যান ইমিউনোলজি, 34 (4), 242-252।
- ফেলো, এমআর, হার্টম্যান, টি।, হার্মেলিন, ডি, ল্যান্ডাউ, জিএম, রোসম্যান্ড, এফ, এবং রোজেনবার্গ, এল। (২০০৯, জুন)। প্লাজেবল হ্যাপ্লোটাইপ ডেটা দ্বারা সীমাবদ্ধ হ্যাপলোটাইপ অনুমান। সম্মিলিত প্যাটার্ন ম্যাচিংয়ের বার্ষিক সিম্পোজিয়ামে (pp। 339-352)। স্প্রিংগার, বার্লিন, হাইডেলবার্গ।
- গ্যাব্রিয়েল, এসবি, শ্যাফনার, এসএফ, এনগুইন, এইচ।, মুর, জেএম, রায়, জে, ব্লুমেনস্টিল, বি,… এবং লিউ-করর্ডো, এসএন (2002)। হিউম্যান জিনোম মধ্যে হেপ্লোটাইপ ব্লক কাঠামো। বিজ্ঞান, 296 (5576), 2225-2229।
- আন্তর্জাতিক হ্যাপম্যাপ কনসোর্টিয়াম। (2005)। মানব জিনোমের একটি হ্যাপ্লোটাইপ মানচিত্র। প্রকৃতি, 437 (7063), 1299।
- উইন, আর।, এবং ওয়াইল্ডিং, সি। (2018)। মাইটোকন্ড্রিয়াল ডিএনএ হ্যাপ্লোটাইপ বৈচিত্র এবং বন্দী বালির বাঘের হাঙ্গর (কারচারিয়াস বৃষ) এর উত্স। চিড়িয়াখানা এবং অ্যাকোয়ারিয়াম গবেষণা জার্নাল, 6 (3), 74-78।
- ইউ, ওয়াইজে, টাং, জে।, ক্যাস্লো, আরএ, এবং জাং, কে। (2007)। বর্তমানের জন্য হ্যাপ্লোটাইপ অনুমান - পূর্বে চিহ্নিত হ্যাপলোটাইপস এবং হ্যাপ্লোটাইপ নিদর্শনগুলি ব্যবহার করে অনুপস্থিত জিনোটাইপ ডেটা। বায়োইনফরম্যাটিকস, 23 (18), 2399-2406।
- তরুণ, এনএস (2018)। সদফ. নিউ ইংল্যান্ড জার্নাল অফ মেডিসিন, 379 (17), 1643-1656।